1966年，“文化大革命”开始，河南农学院停止招生6年。 1971年8月，河南省革委会决定河南农学院迁校许昌县蒋李集办学，学院受河南省和许昌地区双重领导。11月，根据全国教育工作会议精神，郑州粮食学院并入河南农学院改编为粮油工业系。 1972年，根据毛泽东同志关于“要从有实践经验的工人农民中间选拔学生”的指示，采取“自愿报名，群众推荐，领导批准，学校复审”的办法，学院招收了第一批工农兵学员，涉及农学、园林、畜牧、农机4个专业，5月分别在郑州和许昌入学，后因许昌办学条件所限，至1973年春在许昌的师生搬回郑州。1973年7月，河南省革委会决定粮油工业系脱离河南农学院，并入郑州工学院。 1974年招收的新学员全部在许昌入学，涉及农学、植保、园林、畜牧、农机5个专业。大部分教师仍两地奔波，在极其艰苦的条件下维持教学工作。 1975年 3月，学院改名为许昌农学院，仅面向许昌地区招生。学院划归中共许昌地委领导，许昌地委书记王延太兼任院党委第一书记，冯若泉任书记。3～8月间学院加快了搬迁到许昌的步伐，到年底搬迁工作基本结束。改名为许昌农学院后，学院根据许昌地区的特殊需要，在当年招生时增设了烟草专业。同时，还应全省其他地区的要求，开办了面向全省招生的小麦、玉米、植保、兽医、果树、农机等一年制进修班。 1976年，学院开始在许昌地区举办函授教育，面向各县、乡农村干部和知识青年招生，向他们传授农业科学知识。 1972～1976年，学院共招收工农兵大学生1800多名，培训农村干部和知识青年数千人。 1977年7月，河南省委批复了《关于恢复河南农学院的报告》，学院恢复了河南农学院名称。